Возможно ли залить шелл в файл который уже есть на сайте,ну что бы сверху было содержимое файла,а с низу вход в шелл.

нет,файл заменится шеллом

1. Имея доступ к сайту, можно, дохуя
ставишь и усе о_0

2. Можно вставил eval и инклюдить шелл

3. Можно выражаться яснее.