Доступ к httpd.conf есть?
Как правило, для "протокола https" существует отдельный виртуалхост ип:443, и, зачастую, с DocumentRoot в директории, отличной от директории виртуалхоста ип:80 (обычно).
Если нет доступа к конфигу апача, обратись к хостеру. И, возможно, панель управления хостинга позволяет изменить директорию документов, доступных по https