попробуй так - preg_match('/.* \\((.*)\\) .* \\((.*)\\)/i', $subject)
таким образом найдутся 2 строки - id,user_id,date_start,date_finish,type_id,audit_i и '','$_POST[user_id]','$_POST[date_start]', '$_POST[date_finish]','$_POST[holidays_type]','$_SESSION[user_id]'

для каждой строки сделаешь explode() по запятой и сохранишь результаты в разные массивы. В итоге у тебя будут 2 массива со значениями $arr1[0] = 'id' и т.д. и второй массив $arr2[0] = '' и т.д. ну а потом уже склеиваешь их как тебе надо.