Для этого нужно знать структуру твоего линка, знать какие данные он передаёт, хранятся ли у тебя скажем в mysql данные о файлах.

Я бы скажем передал на php скрипт ID файла, который бум скачивать,

потом какая нибудь функция типа readfile();

Ну а потом просто SQL запрос UPDATE значения счетчика.


Это принцип, если надо, могу написать скрипт