Вообще с трудом понял суть проблемы, а что если считать файл побайтово в переменную, далее переменную разбить на Строки
$strings = explode("\r\n", $file);
Далее сделать поиск в кадом ключе $strings[0], [1], [2]... искать кол-во символов "\n" если оно меньше 10, то делать unset($strings[$key]);
Потом склеиваем оставшиеся ключи и перезаписываем файл.

Надеюсь правильно понял суть вопроса =)