Упс. А чтото вы все забыли один хороший способ. Связанный с приложениями отладчиками. В ключе
HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows NT\CurrentVersion\Image File Execution Options\taskmgr.exe
прописать параметр Debugger указывающий на пусть в несуществующей проге или к проге которая ничего не делает или к своей.
т.е. смысл в том, что при старте taskmgr.exe автоматически запустится прога указанная в параметре Debugger. таким образом наша прога получит управленяи первой. А настоящий диспечер задач незапустится

И главное - это будет работать всегда почти. именно такой метод юзает ProcessExplorerNT чтобы запускаться вместо стандартного диспечера задач