Как вариант, записи в таблице могут идти не по порядку (например id=65, id=88, id=1 и тд), поэтому и будет разница, так как лимит берет, например с первой строки по сотую, а по id у тебя получается, например id=1 находится в 101 строке....

Попробуй проверить какой майл к какому id соответствует

concat_ws(0x3a,email,id)

Или выводятся совсем разные данные? (Не то, что должно)