apt install apt-transport-https
cat /etc/apt/sources.list

Удаляешь из surces.list все записи и вставляешь это:

deb https://http.kali.org/kali kali-rolling main non-free contrib
# deb-src https://http.kali.org/kali kali-rolling main non-free contrib

Нжимаешь сохранить. Потом обновляешься.