Вставляешь флешку, открываешь gparted, справа вверху выбираешь из списка свою флешку, правой кнопкой мыши щёлкаешь на окне флешки и выбираешь форматировать, из списка выбираешь файловую систему, и наживаешь стрелочку применить... если не открывается меню форматировать, то сначала нажимаешь отмонтировать.