Недавно у самого были схожие проблемы при дуалбуте W10 c SSD и Kali c HDD. Я использовал образ 2017.3 x64. Проверь в diskmgmt.msc не динамический ли диск, если при разбивке не видит незанятого пространства или диска, оба диска должны быть базовыми. Дальше при установке на этапе выбора дисков выбирай свободное место на HDD и выбирай автоматическое распределение, на этом же этапе найди существующий раздел с загрузчиком MBR W10 на ssd (128мб или больше, скорее всего будет подписан), выбери его и в настройках выбери что-то вроде Use as: mbr(master boot record partition), продолжай установку, ставь grub. После установки загружайся как всегда(ssd первый), только теперь должен будет появится grub с выбором систем для загрузки, это меню можно будет потом отредактировать через grub-customizer.