я бы сам написал на дельфе.

А так экселем можно. В одну колонку все мыла из 2х файлов поп порядку. Во вторую справа формулу =СЛУЧМЕЖДУ(1; офигенно_большое_число ). Упорядочить по возрастанию столбца 2. Скопировать новый список из столбца один в текстовик. Все готово.