Та какая там проблема - правьте /boot/grub/menu.lst

А лучше ставьте на флешку маленькие и быстрые дистрибутивы, такие как puppy или blin. Для поставленных в теме задач - этого за глаза хватит. Плюс такие дистрибутивы обычно сразу есть в виде образов, которые развертываются на флешку.