Также, поверх SSH можно пользоваться SFTP (если разрешено в конфигах sshd). Например, для FAR есть прекрасный плагин winscp, который позволяет передавать файлы по SFTP Также, winscp есть отдельной программой. Так, что не обязательно ставить службу ftp на сервер для передачи файлов