чтобы посмотреть какие у тебя вообще есть разделы введи команду:

df -h

покажет разделы и свободое место на них. подозреваю что у тебя есть один раздел swap и один корневой "/" . если так и есть, то значит раздел /var расположен на той же партиции что и /etc , а /var имеет свойство заполнятся данными. например /var/mysql тут храняться базы, /var/log - логи. вот сходи и почисть логи, скорее всего их накопилось много. после того как увидишь свободное место командой "df -h" должно заработать.