Ну, Минус видимо в высокой загрузке ЦП ?
на это могу сказать, а чего ему ещё делать?
отсутствие железного рейда также влияет на отсутствие BBU, но это решается с помошью UPS, также появляется некоторая гибкость в виде отсутствия привязки к контроллеру.
Да и на 700 УЕ минимум это решение дешевле.

Кстати, mdadm умеет SMP использовать?