Когда то пользовался связкой nginx(фронтенд)+apache, потом как то сервера у меня стали все выделенные, ресурсы росли быстрее, чем задачи, и я плюнул на экономию ресурсов и оставил только apache. И настройки привычнее, и если ставишь какой-нибудь хитровыделанный движок для сайта - всё работает. Хотя, ничего против nginx не имею, вещь хорошая.
Что касается IDE - NetBeans. Не айс, но проблем с лицензиями нет))