У меня была такая ситуация. На ноутбуке стоял SSD Kingston возрастом лет 5 примерно. И тоже тормозил, показывал загрузку диска 80-100%. Чего я только не делал, какие только рекомендации не выполнял - ничего не помогало. Ни переустановка системы, ни отключение различных служб, ни манипуляции с файлом подкачки.

В итоге купил новый SSD Samsung EVO, переустановил - проблемы исчезли! Теперь всё летает. Так что в некоторых случаях эта проблема связана не с системой, а с самим диском.