В вопросах желательно больше деталей и конкретики. Угадывая, что там у тебя и стараясь помочь, расскажу следующее: имею ноут со встроенным модулем от Интел (тут лучше модель, но не буду ) ) и USB от Альфы (тоже не скажу модель :З ). Чтобы корректно работала флешка с wifislax 4.6 (версию указал), пришлось один раз сбросить в БИОС настройки на умолчание, потом прописать загрузку с флешки. После загрузки внутренний модуль иногда (часто) вообще не включается и работает только внешняя Альфа. После перезагрузки уже в Windows и без Альфы, иногда не включается внутренний модуль от Интел, но очень редко. Лечится опять сбросом в БИОС.

А вот флешка с wifislax 4.7.2 (версию указал) всегда требует сброса в БИОС при зарузке и всегда снова сброса после работы с ней для обычной загрузки в Windows без модуля от Альфы. Иначе версия 4.7.2 вообще не видит USB модуля от Альфы, а после работы и отключения Альфы, внутренний модуль без сброса в БИОС не включается.