На одном сайте нашел http://example.com/.git/config файл.

Там же рядышком есть

/.gitignore

/.git/logs/refs/heads/master

/.git/HEAD

Но листинг директорий закрыт. Может кто-то подсказать возможно ли такой репозиторий выкачать?

Пробовал

git clone http://example.com/.git/

Cloning into 'example.com'...

fatal: http://example.com/.git/info/refs not valid: is this a git repository?