И правильно, у Windows есть лимит потоков на процесс. У себя мне удавалось запускать не более 1900 потоков. Но, учитывая текущую архитектуру, изнутри потоков получается в два раза больше (т.е. если активных потоков в окне программы 500, то по факту их 1000), это небольшой архитектурный баг.

Попробуйте режим сканирования поменять (на Fast или Ultra) в настройках.