В нотепад++ есть удобная функция поиска и замены для таких задач, но меня смущает размер файла 28 гиг - вряд ли нотепад сможет его открыть. Чем мучить текстовые редакторы таким размером попытайся всё таки через консоль: команда findstr /B [a-zA-Z] oldlist.txt > newlist.txt сохранит все строки из файла oldlist.txt начинающиеся с буквы в файл newlist.txt. Только естественно нужно подождать пока она закончит.