мне кажется что скрипт испольщует ЧПУ, потому что залиышийся файл имеет ссылку site/download/mydir/file.x, а если нажать из меню на ссылку дириктории в которой лежит файл, то она будет уже site/dir/mydir/. И еще если к адресу приписывать site/dir/mydir/4343/4535/343/ (директории с цифрами не существуют), то сайт откроет(скорее всего делает вид что открыл) все эти папки но они будут пустыми.