Ну на configuration.php права на запись редко бывают, а второй способ оправдал себя на практике. Особенно если есть права на запись в папке с темплейтами - откопировать в неё темплейт с чуть изменёным именем не так уж и палевно.

P.S. есть еще 3-ий вариант - попробывать рутануть (но это уже выходит за рамки темы).