Потому, что сигнал от кварца затем делится делителем, который просто представляет собой счетчик с 32768 состояниями. Если частота кварца 32768 герц, то каждую секунду счетчик переходит в нулевое сотояние.
Иными словами, делить нормально можно только на степени двойки. Поэтому и частота кварца должна быть степенью двойки. При этом погрешность тем меньше, чем больше частота кварца. Вот и получается, что оптимальная частота - 32кгц