Если сервер под управлением Linux, то можно попробовать следующим образом Где ./foo/ - архивируемая папка, а foo.tar - имя тарбала. Потом можно запаковать тарбал либо gzip'ом, либо bzip2.
И в зависимости от того, что разрешено на сервере, менять system().