В индексе пишешь

define("DOSTUP", TRUE);
....
Тут остальной код который нужно

В тех файлах которые закрываешь от просмотра должно быть это
if(!defined("DOSTUP")) die;
...
дальше код который надо
___________________________
Придумал не я. Взято когда то вот из этой статьи (или подобной)
http://www.softtime.ru/info/articlephp.php?id_article=34