Ты у себя на домашнем компе ставить собралась? Поставь готовую сборку http://wampserver.com и не парь себе мозги... То для серверов, хостингов.

А по теме "что быстрее" - различия в нано-секундах).
Я бы предпочел поставить как модуль cgi, так как это более безопасно.