Плохо дело.Если стандартные настройки удалить,то лучше его банально переустановить.
Идём в консоль: Ctrl+Alt+F2 или F1
# apt-get update
# apt-get --reinstall install gnome-terminal
Настройки параметров находятся в файле bashrc в домашней директории.
Ну и на всякий случай дам ссылки по теме настроек:
https://help.gnome.org/users/gnome-...profiles.html.ru#create-profile-from-existing
https://compizomania.blogspot.ru/2012/11/ubuntu_29.html

Интересно,как Вы вообще смогли удалить дефолтный профиль.Он как бы безымянный по-умолчанию.
Его даже из-под рута в настройках терминала не удалить.
Вкладки -то работают? Если да,то можно всё отрегулировать заново.

Я случайно LUKS заголовок затирал но терминал не крашил пока

Edit-Profile Preferences-вверху должна быть вкладка Colors-выбрать её.
Там цвета ,и чуть ниже,бегунок прозрачности.
И вкладку Preferences посмотрите заодно-profile. Есть ли там хоть какой профиль.(чего только не делал с ним,так просто он не удалится)

Правка-Параметры профиля-вверху Цвета .Пробуем
[doublepost=1506281932,1506281020][/doublepost]

apt-get install xfce4-terminal
Это на совсем худой случай.Этот терминал также с настройкой прозрачности идёт
[doublepost=1506282744][/doublepost]

В той же вкладке "Правка"-Параметры Профиля проверте галки ,чтобы стояли на жирности .
И с вкладкой цвета поимпровизировать с настройками (только терминал при этом закрывать и снова открывать требуется)