Линукс же можно тупо перекопировать.
0. Убедились, что карточка успешно читается форматированной в ext2/3
1. Сделали загрузочной - syslinux/grub, делаем раздел активным, одного раздела хватит на всё, если без свапа.
2. добавили в загрузчик запуск (на примере syslinux)
LABEL pm
LINUX /Boot/pmagic/bzImage
INITRD /Boot/pmagic/initrd.img
APPEND edd=off load_ramdisk=1 prompt_ramdisk=0 rw vga=normal loglevel=9 max_loop=256 vmalloc=288MiB directory=/Boot
3.Тупо перекопировали содержимое (linux stage 4) запущенной кали на карточку, аккуратней с /boot/, не подсуньте лишние конфиги.
4. отредактировали /etc/fstab нового экземпляра
всё. (Копипаст)