Вылечил проблему с неправильными параметрами в настройках автозапуска vnc в графическом интерфейсе. Да, там в инструкции в спойлере по автозапуску vnc не хватает параметра ":1". Но это поправимо без сноса системы и траты времени на новую установку.
Команда:
После этого запускаете vnc, подключаетесь к рабочему столу малинки и входите в настройки автозагрузки VNC и правите нужный параметр. Я ленивый и не хочу заново всё ставить, мне помогло.