Mail.ru brute он и расчитан только на взлом майл.ру. Ранние его версии тпе же работали с поддоменами. Но. Майл ру сейчас банит бруты - раньше не знаю. А майл брут точно не пашет через прокси - вернее опция в нём есть, но пароли он не находит. Так что с ним можно работать только напрямую и после очердного бана менять прямой айпи.
Брутус - он сложнее. Зато в нём можно брутить почти любую почту. Что там у него с проксями я не знаю, но по идее лучше всё-таки он.