Проблема типовая для Гнома, причём не только под Дебианом, как у меня: *** скрытое содержание ***
Могу предложить несколько кривых, но работающих решений:
1) Создать нового пользователя, перегнать в него своё окружение и перескочить на этого пользака.
2) Так же можно продолжить работать, загружая гнома в аварийном режиме.
А вот типового красивого решения в Сети пока не видел
В журнале ошибок $HOME/.xsession-errors
Можно создать нового пользователя, а потом посмотреть разницу в конфигах в папке ~/.gnome