Спасибо за верное направление! Проблему удалось решить, но немного не так.
В настройки файрфокса вносил исключения для всплывающих окон - без результата, полностью включал всплывающие окна - без результата.
Как выяснилось с 15.0 версии Firefox использует настройки безопасности (активных элементов, всплывающих элементов и т. д.) из Internet Explorer. До этой версии использовал только свои, с чем связано такое решение программеров непонятно.
Пришлось внести исключения для вплывающих окон, трастовые сайты в настройки IE и все заработало.