Спрашивается, откуда информация о том, что QPC использует HPET?
..ну вот например линк из описания функции QPC: Acquiring high-resolution time stamps - Win32 apps
а так, использование счётчиков системой зависит от версии ОС, аппаратной платформы, и в т.ч. от самого ЦП. Если процессор поддерживает инвариантный счётчик iTSC, то значение этого счётчика калибруется по HPET, о чём говорится в прикреплённой доке.